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时间:2018-07-30    来源:经典美文    点击:

dsc-qx100 第一篇_QX100在微生物相关文献简述

第一篇: Detection of Low-concentration Host mRNA Transcripts in Malawian Children at Risk for Environmental Enteropathy

华盛顿大学医学院儿科和加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院儿科的研究人员建立了一种稳定可靠的基于RNA磁珠提取和微滴式数字PCR的方法,可从粪便样本中检测与EE(热带肠病)关联的人mRNA,灵敏度可达20拷贝GAPDH mRNA/200mg粪便样本。文章发表在2013年1月第一期的J PEDIATR GASTR NUTR(小儿胃肠病学和营养杂志)上。

已有报道表明病人粪便中存在人mRNA,可作为反映病人消化道病理状态的潜在标记物。然而以粪便为样本检测RNA必须克服两大挑战:一是粪便中含有大量PCR抑制剂,会严重影响PCR效率甚至PCR失败;二是粪便样本中的RNA绝大部分是微生物来源的,人mRNA含量极少。所以这项应用需要超灵敏的核酸分离检测技术。

这篇文献中的方法使用了QX100对大量冻存粪便样本中多达70多个基因的表达量进行了分析,其中以GAPDH为内参,探针以VIC标记,各目的基因以FAM标记。所有70个样本都已经双糖吸收测试法检测,同时随机抽取样本用QX100和RT-qPCR进行检测,比较结果显示,ddPCR相对

qPCR具有更高的灵敏度(Figure 2)。基于ddPCR的粪便样本RNA检测手段可用于筛选与消化道疾病相关的核酸标记。

ddPCR exhibited higher sensitivity than qRT-PCR on higher copy number target GAPDH (2.2 times) and lower copy number targets LAP3, TJP1(3.3 times), with a greater relative sensitivity for the latter (Fig. 2).

大家知道定量PCR是通过对实时荧光信号的分析处理进而获得所谓Cq值,再根据Cq来对样品定量。Cq值容易受PCR效率,特别是PCR抑制剂影响,所以qPCR在检测靶标核酸丰度低及抑制成分高的样本时,灵敏度和准确度会大打折扣。而QX100通过PCR终点判断微滴阴阳性进而定量样本的方式,受PCR效率和抑制物影响非常小,特别适合诸如:

1.以粪便、血液为样本的微生物检测、标记物检测;

2.以土壤、污水、淤泥、酒泥等为样本的环境生物学研究和微生物监测;

3.经复杂工艺制作的含大量抑制物的食品材料中转基因成分、动植物成分鉴定和含量分析,及致病微生物的检测(CIQ/CDC);

第二篇:

Quantitative Analysis of Food and Feed Samples with Droplet Digital PCR

当前食品、饲料以及种子中的转基因成分检测主要使用qPCR技术,然而qPCR对低丰度转

基因成分定量检测重复性差,完全依赖标准曲线(而转基因标准物质难以制备)和Cq值定量,但Cq容易受食品饲料中PCR抑制物影响等缺点,制约了qPCR在GMO检测的应用。

相比之下,ddPCR不依赖标准曲线和对照、不受PCR抑制物及PCR效率的影响,通过单分子计数方式实现外源基因拷贝数绝对定量等优势,更适合食品饲料等复杂样本中转基因成分的准确定量检测。

PLOS ONE杂志2013年5月第8卷发表了第一篇QX100应用于GMO检测的文章:“Quantitative Analysis of Food and Feed Samples with Droplet Digital PCR”。这篇文献通过实验论证了ddPCR在GMO检测领域的优点和可行性,并与qPCR以及cdPCR(芯片式数字PCR)作了系统比较。结果显示,ddPCR灵敏度堪比cdPCR和qPCR,其超过4个数量级的动态范围优于cdPCR(2-3个数量级),可满足日常GMO检测需要。此外与qPCR相比,ddPCR对低丰度核酸样本的重复性更好,且对抑制成分不敏感。ddPCR用于GMOS检测的通量和成本优于qPCR和cdPCR,可作为GMOs常规检测技术。

第三篇:

RNA Biol_WitwerKW_June 2013

2011年,Nature网站介绍了中国南京大学张辰宇教授团队的新发现——植物microRNA可以通过日常膳食摄取的方式进入人体的血液和组织器官。并且,一旦进入体内,它们将通过调控人体内靶基因表达的方式影响人体的生理功能,进而发挥生物学作用。这一研究成果公布在Cell research杂志上。

近日,来自约翰·霍普金斯大学医学院的研究人员以尾纤猕猴为研究对象进行了类似研究。这篇文章发表在近期的RNA Biology上。

研究人员先给猕猴饲喂含有丰富miRNA的植物性食物,而后对饲喂前后(0,1,4,12小时)的血液进行miRNA含量的检测。由于miRNA含量较低,使用RT-qPCR进行检测难度较大,实验重复性差,所以研究人员选择了QX100进行植物来源和内源miRNA定量分析。由于目前植物性miRNA在体内如何吸收,进而调控特定基因的机制还不清楚,而且本次实验的研究对象较少,因此,如果想得到确认的实验结论,进一步深入探讨外源miRNA对体内基因的调控机制还需要更多的实验证据。

这些研究都表明植物miRNA可能是食物中的“第七种营养成分”(其他六种分别是水、蛋白质、脂肪酸、碳水化合物、维他命和稀有元素)。一旦得到证实,这一发现将为膳食预防疾病策略及膳食治疗人类疾病的方法提供新的证据和思路。

第四篇: Touchdown digital Polymerase Chain Reaction for Quantification of Highly Conserved Sequences in the HIV-1 Genome

为了对HIV高度保守区域的序列进行检测,该文作者已经采用了常规PCR中的TouchDown技术来对ddPCR的反应条件进行优化,确保TaqMan探针与靶序列特异性的结合以及探针有效地水解累积荧光信

A Unique Y Gene in the Asian Malaria Mosquito Anopheles Stephensi Encodes a Small Lysine-rich Protein and is Transcribed at

采用QX100来确定GUY1基因在雄性与雌性体内的不同拷贝数,即使2者的差别为1个与0个拷贝【dsc-qx100】

第五篇: Development and evaluation of a Next Generation dPCR Diagnostic Assay for Ocular Chlamydia Trachomatis Infections

QX100一个非常大的应用方向是微生物的检测(尤其是复杂来源的样品),之前已有多篇HIV(病毒方面)相关的文献。最近又有2篇QX100对于细菌和衣原体检测方面的文献发表, 结合之前的文献,我们可以给大家一个清晰的概念,QX100可以对复杂来源样品中的病毒、细菌等微生物进行检测,而且是以绝对定量的方式进行,不再需要依赖于标准曲线,简化了实验操作。最新的2篇文献大致介绍如下:

1,由英国科学家完成的采用QX100对沙眼衣原体的检测,发表于J Clinical Microbiol。沙眼衣原体是致盲的一个主要原因,该文章对1509个临床样品进行了双重的ddPCR反应体系与金标准Roche Amplicor CT/NG进行了对比,得到了如下的结论:

"The ddPCR technology has great utility as a diagnostic. Unlike most other NAATs, this method requires no external or internal calibration yet delivers a highly accurate estimation of target load. The inclusion of a human target allows a system of internal control that indicates (but does not discriminate between) experimental failures that are due to either technical PCR failure or to the absence of a sample of human origin in the specimen.

We have validated a highly specific quantitative ddPCR assay and applied it to population monitoring of ocular C. trachomatis infections. This method could rapidly be adapted for use in the detection of sexually transmitted C. trachomatis infections, where a higher sensitivity than that which we have estimated would be desirable. This study represents an early example of the usefulness of this next generation digital PCR method in diagnosing infections in clinical specimens within the arena of infectious diseases."

第六篇:

Detection of Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus by A Duplex ddPCR Polymerase Chain Reaction

由美国科学家完成的采用QX100对耐甲氧 西林的金黄色葡萄球菌(MRSA)检测,也发表于J Clinical Microbiol。MRSA从发现至今感染几乎遍及全球,已成为院内感染的重要病原菌之一,该文章对397个临床样品进行了双重的ddPCR反应体系与Roche 480定量PCR方法进行了对比。也是采用QX100进行细菌定量研究的首篇文献。

第七篇:

Digital Quantitation of Potential Therapeutic Target RNAs

近年来在小RNA的研究方面长非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)的研究成为热点,lncRNA是一类转录本长度超过200个核苷酸的RNA分子的总称。lncRNA的表达水平相对于编码蛋白的基因一般比较低,重要的是很多这些lncRNA虽然不直接参与基因编码和蛋白质合成,但是在基因转录后调控、剪切和修饰具有十分重要的功能,在很多生命活动中均起着举足轻重的作用,和疾病的发生、发展、诊断和治疗有密切的关系,迅速成为当今分子生物学最热门的前沿研究领域之一。另外,lncRNA的亚细胞位置上也呈多样化,在细胞核、细胞质和细胞器均有分布,甚至某些lncRNA具有独特的亚细胞位置,有可能是全新的亚细胞构成。

虽然研究甚少,但是人们逐渐认识到lncRNA具有重要的功能,因此,lncRNA的异常和疾病

关系密切,将成为理解疾病、寻找疾病分子标记物、药物靶点的新的研究方向。

最近美国科学家在NUCLEIC ACID THERAPEUTICS上发表了首篇将QX100应用于lncRNA研究的文献,原文请见附件,其中hightlight的部分供大家参考。

dsc-qx100 第二篇_洗菜机和QX100臭氧消毒洗菜机价格

洗菜机和QX100臭氧消毒洗菜机价格【dsc-qx100】

【dsc-qx100】

dsc-qx100 第三篇_2013年度最佳发明:咖啡酒、羊角甜甜圈、3D打印笔

美国《时代》周刊评选出了2013年的25

项最佳发明,有些很实用:能隐身的摩天大楼、能让瘫痪者重新站立的外骨骼套装;有些很有趣:不能提神的咖啡酒、结合了两种美味的羊角甜甜圈面包。让我们随着这篇文章,一起来看看其中一些令人惊艳的最佳发明吧。

李殊 选

The year 2013 has seen a wide array of inventions, some of them solving problems that we never thought could be solved and others simply making life more fun. Which of these inventions stand out? Check out some of the things that made it into Time magazine’s list of the 25 best inventions of 2013.

The Driverless (Toy) Car

无人驾驶(玩具)汽车

San Francisco-based Anki wants to bring robotics to the people. The company’s first offering is Anki Drive, a $200 racing game in which toy cars can drive themselves. The cars carry sensors that feed data to an iPhone or iPad, which players can use to control speed and position for their cars. Meanwhile, the Anki app computes actions of the enemy cars so they can compete as craftily as the humans.

Gravity’s Lightbox

太空灯箱

For his film Gravity, set entirely in space, director Alfonso Cuarón had to throw out the normal sci-fi playbook. Working with cinematographer Emmanuel Lubezki, he created a “lightbox”: a 20-by-10-ft. (6 by 3 m) structure covered with 196 panels of 4,096 LED bulbs each to simulate the extreme light in outer space. The box had the added bonus of being able to project images that would be added later in CGI, so that the actors had a visual reference.

Alcoholic Coffee

咖啡酒

Portuguese and Spanish researchers writing in the journal LWT—Food Science and Technology announced the birth of a new coffee-based beverage. They dried used grounds, heated the powder in scalding water for 45 minutes, removed the liquid and added sugar and yeast. Then they let the mixture ferment and concentrated it to boost the alcohol content. The result? A booze that’s about 80 proof, like tequila and vodka. It’s good enough to consume , they found, and its taste might improve with age. But beware: this coffee won’t keep you awake, since most of the caffeine disappears as it brews.

Sony’s Smart Lens

索尼智能镜头 With its large sensor, high-quality glass and 3.6x optical zoom, the Sony DSC-QX100 has all the fixings of a high-quality digital camera—but it clips to your iPhone or Android phone. With Sony’s “PlayMemories Mobile” app, your phone acts as the viewfinder. Unattached, it’s the remote control. The DSC-QX100 is a bit too big to fit in a jeans pocket but plenty small enough for a bag. It retails for $499.

The Cronut

羊角甜甜圈面包

In 2013 a new fusion food joined the ranks of the ice cream cake and the turducken. The cronut—made of croissant-style pastry that’s fried like a doughnut, filled with cream and topped with glaze—transfixed foodies when New York City chef Dominique Ansel started selling it in May. His recipe inspired imitations around the world, and customers proved willing to wait hours for a taste; scalpers were even hawking the $5 treats for up to $40. The 3Doodler

3D打印笔

Enjoy doodling? The 3Doodler promises to make it more fun. The pen doodles in three dimensions instead of two. Essentially it works like a 3-D printer, melting and cooling colored plastic to create freestanding structures in any shape imaginable. Invented by Maxwell Bogue, Peter Dilworth and Daniel Cowen at the Boston-based toy company WobbleWorks, the 3Doodler raised over $2 million on Kickstarter, the world’s largest funding platform for creative projects.

(来源:英语学习杂志 编辑:丹妮)

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dsc-qx100 第四篇_时代周刊杂志揭晓2013年度25项全球最佳发明

《时代周刊》杂志揭晓2013年度25项全球最佳发明:太空灯箱、

LED重力灯、3D打印笔均在列

摘要:近日,作为当代全球最具代表性与影响力的杂志刊物,美国《时代周刊》评选出2013年度25项全球最佳发明,太空灯箱、LED重力灯、3

近日,作为当代全球最具代表性与影响力的杂志刊物,美国《时代周刊》评选出2013年度25项全球最佳发明,太空灯箱、LED重力灯、3D打印笔赫然在列,而在这25项最佳发明中排在首位的是无人驾驶玩具汽车,下面我们来看看其他最佳发明都有哪些。

1.无人驾驶(玩具)汽车:人工智能初创企业Anki开发出无人驾驶玩具汽车,它携带的传感器可接收iPhone或 iPad数据,使玩家很容易控制其速度和方向,能与谷歌无人驾驶汽车相匹敌。

2.太空灯箱:电影《地心引力》摄影师卢贝兹基与视觉特效总监韦伯设计出“太空灯箱”,这个18平方米的太空灯箱上有196个镶嵌板,由4096个LED灯泡组成,每个都可模拟太空中的发光体。

3.咖啡酒:葡萄牙和西班牙研究人员研制成咖啡酒。将咖啡渣放在滚水中煮45分钟,去水后加糖和酵母,然后让混合物发酵提纯,最后制出的一种类似伏特加和龙舌兰酒的新饮料,不过,咖啡酒终究是酒,不会像咖啡一样达到提神的效果。【dsc-qx100】

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4.索尼智能镜头:DSC-QX100镜头有更大传感器、高品质玻璃和3.6倍光学焦距,可用于iPhone等智能手机,让手机变成遥控取景器。

5.羊角甜甜圈面包:纽约大厨多米尼克-安塞尔5月份推出以来一种奶油夹心、上面淋着诱人糖浆的“甜甜圈+羊角面包”,它的配方风靡全世界,许多人宁愿等数小时排队也要品尝。黄牛党将每份从5美元炒到40美元。

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6.电动摩托赛车Mission R:这种机械怪兽发动机可达160马力,从0加速到60迈只需3秒钟,最高时速240公里,无需充电可行驶225公里 。但它零排放,没有内燃机噪音,数字触屏控制。

7.漂流水池:3名华裔设计师为纽约东河设立一种漂流水池,即可清理河水,又能让人有个游泳的地方。这个水池呈加号状,将让纽约人100年来首次在东河中潜水。

8.头戴式虚拟现实眼镜:头戴式虚拟现实眼镜Oculus Rift可让玩家在三维环境中体验身临其境感觉。通过改善头部追踪功能,创造宽广的视野,以低廉成本创造家庭版虚拟现实装置。

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